Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA6P23229 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms