Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA1P23193 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms