Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT1P21579 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT1P21579 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT1P21579 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT1P21579 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT1P21579 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT1P21579 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT1P21579 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT1P21579 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT1P21579 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT1P21579 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT1P21579 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT1P21579 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT1P21579 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT1P21579 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT1P21579 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT1P21579 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT1P21579 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT1P21579 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYT1P21579 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT1P21579 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT1P21579 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT1P21579 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT1P21579 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT1P21579 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT1P21579 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT1P21579 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT1P21579 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT1P21579 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT1P21579 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT1P21579 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT1P21579 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT1P21579 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT1P21579 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT1P21579 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT1P21579 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT1P21579 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT1P21579 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT1P21579 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT1P21579 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT1P21579 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT1P21579 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT1P21579 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT1P21579 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT1P21579 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT1P21579 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT1P21579 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT1P21579 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT1P21579 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT1P21579 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT1P21579 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT1P21579 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT1P21579 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT1P21579 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT1P21579 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT1P21579 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT1P21579 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT1P21579 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT1P21579 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT1P21579 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT1P21579 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT1P21579 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT1P21579 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT1P21579 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT1P21579 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT1P21579 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT1P21579 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT1P21579 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT1P21579 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT1P21579 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT1P21579 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT1P21579 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT1P21579 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT1P21579 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT1P21579 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT1P21579 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT1P21579 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT1P21579 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT1P21579 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT1P21579 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT1P21579 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT1P21579 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT1P21579 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT1P21579 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT1P21579 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT1P21579 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT1P21579 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT1P21579 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT1P21579 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT1P21579 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT1P21579 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT1P21579 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT1P21579 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT1P21579 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT1P21579 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT1P21579 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT1P21579 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT1P21579 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT1P21579 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT1P21579 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms