Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
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