Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN2P17655 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms