Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
TOP2AP11388 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms