Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD28P10747 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD28P10747 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD28P10747 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD28P10747 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD28P10747 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD28P10747 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CD28P10747 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD28P10747 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD28P10747 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CD28P10747 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CD28P10747 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD28P10747 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD28P10747 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD28P10747 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CD28P10747 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD28P10747 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD28P10747 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD28P10747 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD28P10747 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD28P10747 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD28P10747 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD28P10747 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD28P10747 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD28P10747 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD28P10747 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CD28P10747 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD28P10747 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD28P10747 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD28P10747 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD28P10747 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD28P10747 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD28P10747 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD28P10747 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD28P10747 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD28P10747 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD28P10747 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD28P10747 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD28P10747 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD28P10747 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CD28P10747 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD28P10747 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CD28P10747 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD28P10747 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD28P10747 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD28P10747 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD28P10747 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD28P10747 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD28P10747 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD28P10747 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD28P10747 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD28P10747 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD28P10747 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD28P10747 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD28P10747 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD28P10747 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD28P10747 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD28P10747 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD28P10747 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD28P10747 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD28P10747 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD28P10747 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD28P10747 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD28P10747 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD28P10747 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD28P10747 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD28P10747 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD28P10747 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD28P10747 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD28P10747 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD28P10747 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD28P10747 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD28P10747 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD28P10747 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD28P10747 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD28P10747 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CD28P10747 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD28P10747 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD28P10747 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD28P10747 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD28P10747 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD28P10747 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD28P10747 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CD28P10747 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD28P10747 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD28P10747 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD28P10747 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD28P10747 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD28P10747 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD28P10747 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD28P10747 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD28P10747 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD28P10747 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD28P10747 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD28P10747 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD28P10747 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD28P10747 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD28P10747 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD28P10747 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CD28P10747 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms