Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GLI3P10071 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GLI3P10071 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GLI3P10071 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GLI3P10071 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GLI3P10071 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GLI3P10071 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GLI3P10071 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GLI3P10071 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GLI3P10071 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GLI3P10071 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GLI3P10071 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GLI3P10071 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GLI3P10071 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GLI3P10071 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GLI3P10071 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GLI3P10071 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GLI3P10071 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GLI3P10071 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GLI3P10071 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GLI3P10071 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GLI3P10071 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GLI3P10071 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GLI3P10071 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GLI3P10071 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GLI3P10071 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GLI3P10071 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GLI3P10071 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GLI3P10071 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GLI3P10071 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GLI3P10071 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GLI3P10071 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
GLI3P10071 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GLI3P10071 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GLI3P10071 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GLI3P10071 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GLI3P10071 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GLI3P10071 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GLI3P10071 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GLI3P10071 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GLI3P10071 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GLI3P10071 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GLI3P10071 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GLI3P10071 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GLI3P10071 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GLI3P10071 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GLI3P10071 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GLI3P10071 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GLI3P10071 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GLI3P10071 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GLI3P10071 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GLI3P10071 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GLI3P10071 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GLI3P10071 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GLI3P10071 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GLI3P10071 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GLI3P10071 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GLI3P10071 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GLI3P10071 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GLI3P10071 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GLI3P10071 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GLI3P10071 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GLI3P10071 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GLI3P10071 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GLI3P10071 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GLI3P10071 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GLI3P10071 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GLI3P10071 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GLI3P10071 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GLI3P10071 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GLI3P10071 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GLI3P10071 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GLI3P10071 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GLI3P10071 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GLI3P10071 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GLI3P10071 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GLI3P10071 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GLI3P10071 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GLI3P10071 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GLI3P10071 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GLI3P10071 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GLI3P10071 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GLI3P10071 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GLI3P10071 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GLI3P10071 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GLI3P10071 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GLI3P10071 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GLI3P10071 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GLI3P10071 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GLI3P10071 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GLI3P10071 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GLI3P10071 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GLI3P10071 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GLI3P10071 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GLI3P10071 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GLI3P10071 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GLI3P10071 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GLI3P10071 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GLI3P10071 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI3P10071 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms