Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GLI2P10070 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GLI2P10070 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GLI2P10070 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GLI2P10070 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GLI2P10070 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GLI2P10070 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
GLI2P10070 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GLI2P10070 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GLI2P10070 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GLI2P10070 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
GLI2P10070 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GLI2P10070 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GLI2P10070 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
GLI2P10070 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GLI2P10070 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GLI2P10070 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GLI2P10070 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GLI2P10070 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GLI2P10070 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GLI2P10070 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GLI2P10070 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GLI2P10070 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GLI2P10070 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
GLI2P10070 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GLI2P10070 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GLI2P10070 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GLI2P10070 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
GLI2P10070 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GLI2P10070 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GLI2P10070 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GLI2P10070 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GLI2P10070 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GLI2P10070 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
GLI2P10070 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GLI2P10070 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GLI2P10070 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GLI2P10070 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GLI2P10070 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GLI2P10070 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GLI2P10070 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GLI2P10070 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GLI2P10070 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GLI2P10070 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
GLI2P10070 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GLI2P10070 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GLI2P10070 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GLI2P10070 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GLI2P10070 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GLI2P10070 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GLI2P10070 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
GLI2P10070 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
GLI2P10070 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GLI2P10070 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GLI2P10070 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
GLI2P10070 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GLI2P10070 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GLI2P10070 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GLI2P10070 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GLI2P10070 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
GLI2P10070 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GLI2P10070 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GLI2P10070 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GLI2P10070 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GLI2P10070 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GLI2P10070 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GLI2P10070 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GLI2P10070 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
GLI2P10070 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GLI2P10070 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GLI2P10070 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GLI2P10070 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GLI2P10070 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GLI2P10070 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GLI2P10070 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GLI2P10070 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GLI2P10070 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GLI2P10070 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GLI2P10070 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GLI2P10070 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GLI2P10070 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GLI2P10070 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GLI2P10070 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GLI2P10070 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GLI2P10070 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GLI2P10070 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GLI2P10070 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GLI2P10070 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GLI2P10070 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GLI2P10070 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GLI2P10070 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GLI2P10070 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GLI2P10070 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GLI2P10070 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GLI2P10070 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GLI2P10070 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GLI2P10070 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GLI2P10070 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GLI2P10070 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GLI2P10070 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms