Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTA1P02549 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SPTA1P02549 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTA1P02549 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTA1P02549 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTA1P02549 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTA1P02549 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTA1P02549 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTA1P02549 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTA1P02549 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTA1P02549 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTA1P02549 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTA1P02549 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTA1P02549 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTA1P02549 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTA1P02549 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTA1P02549 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTA1P02549 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTA1P02549 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTA1P02549 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTA1P02549 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTA1P02549 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTA1P02549 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTA1P02549 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTA1P02549 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTA1P02549 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTA1P02549 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTA1P02549 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTA1P02549 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTA1P02549 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTA1P02549 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTA1P02549 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTA1P02549 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTA1P02549 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTA1P02549 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTA1P02549 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms