Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-AP01891 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-AP01891 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms