Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTAP01374 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTAP01374 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTAP01374 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTAP01374 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTAP01374 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTAP01374 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LTAP01374 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LTAP01374 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LTAP01374 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LTAP01374 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LTAP01374 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LTAP01374 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LTAP01374 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LTAP01374 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LTAP01374 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LTAP01374 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LTAP01374 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LTAP01374 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LTAP01374 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LTAP01374 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LTAP01374 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LTAP01374 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LTAP01374 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LTAP01374 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LTAP01374 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LTAP01374 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LTAP01374 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LTAP01374 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LTAP01374 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LTAP01374 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LTAP01374 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LTAP01374 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LTAP01374 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LTAP01374 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LTAP01374 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LTAP01374 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LTAP01374 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LTAP01374 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LTAP01374 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LTAP01374 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LTAP01374 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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LTAP01374 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LTAP01374 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LTAP01374 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LTAP01374 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LTAP01374 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LTAP01374 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LTAP01374 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LTAP01374 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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LTAP01374 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LTAP01374 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LTAP01374 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LTAP01374 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LTAP01374 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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LTAP01374 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LTAP01374 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LTAP01374 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTAP01374 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTAP01374 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LTAP01374 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LTAP01374 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTAP01374 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LTAP01374 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTAP01374 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LTAP01374 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTAP01374 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTAP01374 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTAP01374 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTAP01374 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LTAP01374 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LTAP01374 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTAP01374 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTAP01374 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTAP01374 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTAP01374 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTAP01374 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTAP01374 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LTAP01374 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTAP01374 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTAP01374 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTAP01374 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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