Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PCNTO95613 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCNTO95613 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCNTO95613 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCNTO95613 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCNTO95613 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCNTO95613 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCNTO95613 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCNTO95613 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCNTO95613 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCNTO95613 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCNTO95613 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCNTO95613 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PCNTO95613 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PCNTO95613 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCNTO95613 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCNTO95613 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCNTO95613 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCNTO95613 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCNTO95613 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNTO95613 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNTO95613 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNTO95613 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNTO95613 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNTO95613 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNTO95613 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNTO95613 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNTO95613 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNTO95613 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNTO95613 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNTO95613 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNTO95613 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNTO95613 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNTO95613 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNTO95613 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNTO95613 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNTO95613 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNTO95613 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNTO95613 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNTO95613 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNTO95613 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNTO95613 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNTO95613 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNTO95613 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNTO95613 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCNTO95613 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCNTO95613 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PCNTO95613 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCNTO95613 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCNTO95613 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PCNTO95613 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCNTO95613 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PCNTO95613 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCNTO95613 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCNTO95613 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNTO95613 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNTO95613 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNTO95613 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNTO95613 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNTO95613 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNTO95613 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNTO95613 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNTO95613 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNTO95613 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNTO95613 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNTO95613 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNTO95613 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNTO95613 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNTO95613 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNTO95613 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNTO95613 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNTO95613 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCNTO95613 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCNTO95613 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCNTO95613 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCNTO95613 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCNTO95613 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCNTO95613 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCNTO95613 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCNTO95613 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCNTO95613 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PCNTO95613 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCNTO95613 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PCNTO95613 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCNTO95613 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCNTO95613 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNTO95613 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNTO95613 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNTO95613 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNTO95613 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNTO95613 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNTO95613 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNTO95613 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNTO95613 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNTO95613 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNTO95613 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNTO95613 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNTO95613 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNTO95613 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNTO95613 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms