Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD4O95243 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD4O95243 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD4O95243 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD4O95243 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD4O95243 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD4O95243 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD4O95243 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD4O95243 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD4O95243 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD4O95243 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD4O95243 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD4O95243 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD4O95243 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD4O95243 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD4O95243 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD4O95243 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD4O95243 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD4O95243 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD4O95243 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD4O95243 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD4O95243 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD4O95243 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD4O95243 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD4O95243 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD4O95243 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD4O95243 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD4O95243 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD4O95243 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD4O95243 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD4O95243 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD4O95243 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD4O95243 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD4O95243 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD4O95243 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD4O95243 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD4O95243 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD4O95243 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD4O95243 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD4O95243 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD4O95243 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD4O95243 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD4O95243 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD4O95243 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD4O95243 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD4O95243 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD4O95243 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD4O95243 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD4O95243 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD4O95243 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD4O95243 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD4O95243 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD4O95243 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD4O95243 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD4O95243 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD4O95243 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD4O95243 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD4O95243 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD4O95243 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD4O95243 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD4O95243 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD4O95243 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD4O95243 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD4O95243 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD4O95243 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD4O95243 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD4O95243 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD4O95243 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD4O95243 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD4O95243 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD4O95243 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD4O95243 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD4O95243 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD4O95243 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD4O95243 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD4O95243 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD4O95243 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD4O95243 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD4O95243 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD4O95243 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD4O95243 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD4O95243 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD4O95243 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD4O95243 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD4O95243 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD4O95243 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD4O95243 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD4O95243 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD4O95243 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD4O95243 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD4O95243 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD4O95243 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD4O95243 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD4O95243 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD4O95243 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD4O95243 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD4O95243 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD4O95243 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD4O95243 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD4O95243 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms