Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKAP2O75563 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms