Protein–RNA interactions for Protein: O43824

GTPBP6, Putative GTP-binding protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP6O43824 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTPBP6O43824 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTPBP6O43824 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms