Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRNO43815 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRNO43815 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRNO43815 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRNO43815 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRNO43815 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRNO43815 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRNO43815 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRNO43815 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRNO43815 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRNO43815 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRNO43815 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRNO43815 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRNO43815 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRNO43815 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRNO43815 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRNO43815 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRNO43815 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRNO43815 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
STRNO43815 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRNO43815 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRNO43815 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRNO43815 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRNO43815 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRNO43815 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRNO43815 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRNO43815 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRNO43815 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRNO43815 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRNO43815 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRNO43815 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRNO43815 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRNO43815 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRNO43815 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRNO43815 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRNO43815 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRNO43815 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
STRNO43815 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRNO43815 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRNO43815 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRNO43815 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRNO43815 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRNO43815 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRNO43815 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRNO43815 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRNO43815 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRNO43815 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRNO43815 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRNO43815 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRNO43815 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRNO43815 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRNO43815 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRNO43815 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRNO43815 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRNO43815 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRNO43815 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRNO43815 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STRNO43815 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STRNO43815 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
STRNO43815 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STRNO43815 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRNO43815 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRNO43815 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRNO43815 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRNO43815 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRNO43815 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRNO43815 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
STRNO43815 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRNO43815 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRNO43815 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
STRNO43815 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRNO43815 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRNO43815 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRNO43815 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRNO43815 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRNO43815 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRNO43815 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRNO43815 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRNO43815 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRNO43815 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRNO43815 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRNO43815 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRNO43815 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRNO43815 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRNO43815 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRNO43815 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRNO43815 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRNO43815 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRNO43815 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRNO43815 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRNO43815 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRNO43815 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRNO43815 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRNO43815 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRNO43815 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STRNO43815 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRNO43815 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRNO43815 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRNO43815 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRNO43815 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms