Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRC1O43663 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRC1O43663 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRC1O43663 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRC1O43663 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRC1O43663 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRC1O43663 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRC1O43663 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRC1O43663 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRC1O43663 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRC1O43663 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRC1O43663 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRC1O43663 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRC1O43663 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRC1O43663 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRC1O43663 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRC1O43663 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRC1O43663 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRC1O43663 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRC1O43663 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRC1O43663 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRC1O43663 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRC1O43663 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRC1O43663 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRC1O43663 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRC1O43663 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRC1O43663 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRC1O43663 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRC1O43663 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRC1O43663 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRC1O43663 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRC1O43663 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRC1O43663 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRC1O43663 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRC1O43663 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRC1O43663 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRC1O43663 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRC1O43663 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRC1O43663 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRC1O43663 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRC1O43663 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRC1O43663 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRC1O43663 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRC1O43663 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRC1O43663 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRC1O43663 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRC1O43663 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRC1O43663 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRC1O43663 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRC1O43663 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PRC1O43663 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRC1O43663 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRC1O43663 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRC1O43663 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRC1O43663 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRC1O43663 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRC1O43663 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRC1O43663 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRC1O43663 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRC1O43663 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRC1O43663 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRC1O43663 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRC1O43663 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRC1O43663 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRC1O43663 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRC1O43663 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRC1O43663 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRC1O43663 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRC1O43663 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRC1O43663 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRC1O43663 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRC1O43663 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRC1O43663 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRC1O43663 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRC1O43663 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRC1O43663 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRC1O43663 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRC1O43663 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRC1O43663 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRC1O43663 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRC1O43663 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRC1O43663 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRC1O43663 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRC1O43663 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRC1O43663 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRC1O43663 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRC1O43663 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRC1O43663 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRC1O43663 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRC1O43663 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRC1O43663 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRC1O43663 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRC1O43663 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRC1O43663 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRC1O43663 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRC1O43663 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRC1O43663 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRC1O43663 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRC1O43663 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRC1O43663 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms