Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VGFO15240 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VGFO15240 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VGFO15240 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VGFO15240 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VGFO15240 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VGFO15240 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VGFO15240 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
VGFO15240 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VGFO15240 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
VGFO15240 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VGFO15240 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
VGFO15240 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VGFO15240 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VGFO15240 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VGFO15240 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VGFO15240 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VGFO15240 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VGFO15240 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VGFO15240 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VGFO15240 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
VGFO15240 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VGFO15240 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VGFO15240 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VGFO15240 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VGFO15240 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VGFO15240 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VGFO15240 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VGFO15240 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
VGFO15240 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VGFO15240 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VGFO15240 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VGFO15240 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VGFO15240 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VGFO15240 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VGFO15240 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VGFO15240 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VGFO15240 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VGFO15240 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VGFO15240 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VGFO15240 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VGFO15240 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VGFO15240 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VGFO15240 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VGFO15240 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VGFO15240 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VGFO15240 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VGFO15240 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
VGFO15240 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
VGFO15240 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
VGFO15240 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
VGFO15240 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VGFO15240 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VGFO15240 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VGFO15240 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VGFO15240 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VGFO15240 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VGFO15240 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VGFO15240 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VGFO15240 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VGFO15240 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
VGFO15240 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VGFO15240 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VGFO15240 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VGFO15240 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VGFO15240 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VGFO15240 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
VGFO15240 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VGFO15240 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VGFO15240 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VGFO15240 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VGFO15240 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
VGFO15240 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VGFO15240 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VGFO15240 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VGFO15240 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VGFO15240 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VGFO15240 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VGFO15240 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VGFO15240 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VGFO15240 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VGFO15240 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VGFO15240 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VGFO15240 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VGFO15240 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VGFO15240 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VGFO15240 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VGFO15240 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VGFO15240 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VGFO15240 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VGFO15240 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
VGFO15240 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VGFO15240 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VGFO15240 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VGFO15240 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VGFO15240 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
VGFO15240 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VGFO15240 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VGFO15240 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VGFO15240 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms