Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLRMTO00411 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms