Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DFFAO00273 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DFFAO00273 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DFFAO00273 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DFFAO00273 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DFFAO00273 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DFFAO00273 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DFFAO00273 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DFFAO00273 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DFFAO00273 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DFFAO00273 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DFFAO00273 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DFFAO00273 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DFFAO00273 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DFFAO00273 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DFFAO00273 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DFFAO00273 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DFFAO00273 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DFFAO00273 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DFFAO00273 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DFFAO00273 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DFFAO00273 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DFFAO00273 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DFFAO00273 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DFFAO00273 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DFFAO00273 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DFFAO00273 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DFFAO00273 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DFFAO00273 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DFFAO00273 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DFFAO00273 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DFFAO00273 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DFFAO00273 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DFFAO00273 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DFFAO00273 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DFFAO00273 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DFFAO00273 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DFFAO00273 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DFFAO00273 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DFFAO00273 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DFFAO00273 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DFFAO00273 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DFFAO00273 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DFFAO00273 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DFFAO00273 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DFFAO00273 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DFFAO00273 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DFFAO00273 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DFFAO00273 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DFFAO00273 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DFFAO00273 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DFFAO00273 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DFFAO00273 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DFFAO00273 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DFFAO00273 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DFFAO00273 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DFFAO00273 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DFFAO00273 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DFFAO00273 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DFFAO00273 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DFFAO00273 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DFFAO00273 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DFFAO00273 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DFFAO00273 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DFFAO00273 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DFFAO00273 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DFFAO00273 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DFFAO00273 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DFFAO00273 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DFFAO00273 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DFFAO00273 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DFFAO00273 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DFFAO00273 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DFFAO00273 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DFFAO00273 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DFFAO00273 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DFFAO00273 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DFFAO00273 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DFFAO00273 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DFFAO00273 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DFFAO00273 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DFFAO00273 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DFFAO00273 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DFFAO00273 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DFFAO00273 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DFFAO00273 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DFFAO00273 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DFFAO00273 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DFFAO00273 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DFFAO00273 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DFFAO00273 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DFFAO00273 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DFFAO00273 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DFFAO00273 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DFFAO00273 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DFFAO00273 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DFFAO00273 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DFFAO00273 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DFFAO00273 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DFFAO00273 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms