Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NFKBIEO00221 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms