Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCER2I3L3R5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCER2I3L3R5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms