Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms