Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVV-2B6SEH9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms