Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4E171 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4E171 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4E171 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4E171 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4E171 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4E171 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4E171 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4E171 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4E171 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4E171 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4E171 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
B4E171 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
B4E171 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4E171 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4E171 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
B4E171 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4E171 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4E171 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4E171 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4E171 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4E171 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4E171 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
B4E171 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4E171 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4E171 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4E171 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4E171 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4E171 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4E171 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4E171 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4E171 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4E171 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4E171 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4E171 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4E171 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4E171 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4E171 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
B4E171 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4E171 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4E171 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4E171 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4E171 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4E171 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4E171 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4E171 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4E171 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4E171 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4E171 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4E171 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4E171 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4E171 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4E171 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4E171 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4E171 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4E171 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
B4E171 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4E171 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4E171 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
B4E171 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4E171 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4E171 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4E171 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4E171 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4E171 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4E171 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4E171 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4E171 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4E171 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4E171 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4E171 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4E171 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4E171 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
B4E171 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
B4E171 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
B4E171 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4E171 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4E171 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4E171 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4E171 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4E171 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4E171 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4E171 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4E171 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4E171 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
B4E171 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
B4E171 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
B4E171 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4E171 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4E171 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4E171 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
B4E171 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4E171 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4E171 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4E171 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4E171 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4E171 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4E171 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4E171 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4E171 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms