Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYSRT1A8MQ03 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms