Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms