Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

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Length 3,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XIRP2A4UGR9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XIRP2A4UGR9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XIRP2A4UGR9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XIRP2A4UGR9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
XIRP2A4UGR9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XIRP2A4UGR9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XIRP2A4UGR9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XIRP2A4UGR9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XIRP2A4UGR9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
XIRP2A4UGR9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XIRP2A4UGR9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XIRP2A4UGR9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
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