Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
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ZNF548Q8NEK5 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
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ZNF548Q8NEK5 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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ZNF548Q8NEK5 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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