Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms