Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NPRL3Q12980 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms