Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ECHS1P30084 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ECHS1P30084 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECHS1P30084 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECHS1P30084 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECHS1P30084 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECHS1P30084 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECHS1P30084 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECHS1P30084 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECHS1P30084 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECHS1P30084 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECHS1P30084 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECHS1P30084 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECHS1P30084 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ECHS1P30084 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 AL137847.1-201ENST00000416473 444 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 AC007204.1-201ENST00000621794 555 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ECHS1P30084 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.4 ms