Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 TSHZ2-205ENST00000626626 670 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 GLRA3-201ENST00000274093 8770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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PTPRAP18433 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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PTPRAP18433 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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PTPRAP18433 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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PTPRAP18433 APP-206ENST00000359726 3294 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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PTPRAP18433 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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