Protein–RNA interactions for Protein: O95628

CNOT4, CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4O95628 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CNOT4O95628 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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