Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC008013.2-201ENST00000537555 348 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 PPIAL4D-201ENST00000544708 495 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AL121820.1-201ENST00000556919 461 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 PCAT29-202ENST00000558941 545 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 CDRT8-201ENST00000579752 467 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 GAS2-210ENST00000630668 674 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 LDHA-204ENST00000396222 1766 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 FOPNL-206ENST00000573968 2039 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 OR10W1-201ENST00000395079 1469 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 STAT2-202ENST00000418572 1548 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 OR10J3-201ENST00000332217 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP79-201ENST00000365193 109 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB3P1-201ENST00000393368 573 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP261-201ENST00000410948 278 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC090617.1-201ENST00000413674 323 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 SNX19-202ENST00000426933 888 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 DDX11L10-201ENST00000430178 571 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL590682.1-201ENST00000437248 344 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC234771.3-201ENST00000454984 622 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL635P-201ENST00000492123 296 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC092818.1-201ENST00000523411 639 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC079313.2-201ENST00000550474 564 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC027796.5-201ENST00000573568 560 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 MIR5192-201ENST00000579892 92 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 GMDS-AS1-215ENST00000606884 580 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC143336.1-201ENST00000614164 836 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC018558.4-201ENST00000622153 281 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 GOSR2-222ENST00000639031 885 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 DCP1A-201ENST00000294241 1853 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 SYNPR-204ENST00000460711 2383 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms