Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 LINC00649-203ENST00000427447 9124 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC8.11□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC8.11□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC8.11□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 AC093829.1-201ENST00000506662 1618 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
GAPVD1Q14C86 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms