Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 NCEH1-206ENST00000543711 4062 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AL161891.1-201ENST00000621575 4636 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 OR10AD1-201ENST00000310248 1305 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 SF3A3P1-201ENST00000446317 1477 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 PARP9-205ENST00000477522 3128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 LINC02436-202ENST00000509017 2186 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 KCNA2-214ENST00000640774 6673 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 SLC36A3-201ENST00000335230 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 LPAR6-202ENST00000378434 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 GUCY2F-201ENST00000218006 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 GJA5-202ENST00000579774 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 OR2G6-203ENST00000641804 6084 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 CYP27C1-201ENST00000335247 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 CDADC1-201ENST00000251108 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 CLEC1A-201ENST00000315330 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 ZNF441-201ENST00000357901 4356 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 TMED8-201ENST00000216468 7784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 RIT2-201ENST00000326695 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 RNU1-122P-201ENST00000365538 156 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 U3.38-201ENST00000408534 216 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 RN7SKP127-201ENST00000410443 354 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AP000997.1-201ENST00000424313 479 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AL590682.1-201ENST00000437248 344 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC009269.1-202ENST00000484381 469 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 SCARNA18.2-201ENST00000516882 84 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 PBLD-203ENST00000336578 2449 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC242022.1-201ENST00000638002 1565 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 STXBP5L-208ENST00000497029 3036 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 DROSHA-220ENST00000513349 4681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 CD164-203ENST00000324953 2936 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 SLF2-203ENST00000370271 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 TTC28-208ENST00000612946 11274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 TMX2-201ENST00000278422 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 USP32P2-201ENST00000412260 4329 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 OR8B9P-202ENST00000642028 5216 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 UTY-210ENST00000538878 6574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 UTY-213ENST00000612274 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 LINC01814-202ENST00000454224 8839 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 MAP3K9-207ENST00000611979 10497 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 FAM114A1-201ENST00000358869 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 EPB41L2-221ENST00000529208 3023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AKAP4-202ENST00000376064 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 ADAM2-205ENST00000521880 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 LPAR1-205ENST00000541779 2490 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 SAMMSON-203ENST00000641005 2168 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 MAP4K4-219ENST00000625522 7458 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 LARP1B-210ENST00000512292 3105 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 BRS3-201ENST00000370648 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms