Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC013731.1-201ENST00000604340 883 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 HEMGN-201ENST00000259456 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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PTPN13Q12923 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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PTPN13Q12923 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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PTPN13Q12923 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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PTPN13Q12923 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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