Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 SERPINA5-208ENST00000554866 2211 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 ERMAP-202ENST00000372514 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 CLEC4M-204ENST00000359059 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 CSE1L-202ENST00000396192 3459 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 MYO5A-213ENST00000613858 12139 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 B4GALNT2-203ENST00000504681 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 CLIP4-204ENST00000404424 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 SPATA7-202ENST00000356583 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 TARS-202ENST00000455217 2523 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 RNA5SP349-201ENST00000363743 109 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 GSTA6P-201ENST00000424144 582 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 RN7SL130P-201ENST00000489463 305 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 NDUFA12-204ENST00000547157 276 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 TGFB3-AS1-201ENST00000553732 580 ntTSL 4 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 AC009686.2-201ENST00000607017 577 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 AP004247.4-201ENST00000608484 942 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 AC011472.5-201ENST00000624079 508 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 AL137798.2-201ENST00000633763 817 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 MROH3P-202ENST00000635940 2556 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 SULF2-206ENST00000467815 3905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 TUBBP10-201ENST00000427668 1301 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 LINC00870-202ENST00000473713 2693 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 ALOXE3-202ENST00000380149 3362 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 PMS2-206ENST00000441476 2730 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 EXD2-202ENST00000409014 3404 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 RFESD-203ENST00000458310 2788 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 NR4A2-201ENST00000339562 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 EP400NL-208ENST00000475841 7090 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 GNL3L-202ENST00000360845 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 MOCS1-203ENST00000373186 4256 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 KDM4D-203ENST00000610872 2191 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 C1S-205ENST00000406697 3076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 LINC01806-202ENST00000439050 2333 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 MIR3663HG-201ENST00000419373 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 RNF31-211ENST00000559275 3198 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 CREB3L2-201ENST00000330387 7412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 ZBTB21-203ENST00000398499 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 ARID1B-210ENST00000635849 5830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 PALB2-201ENST00000261584 4003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 ATF2-206ENST00000409635 2109 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 STARD4-212ENST00000512160 3500 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 AC048380.2-201ENST00000624725 3548 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 FAM111B-204ENST00000529618 2364 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 RNU1-67P-201ENST00000384446 164 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 RPL13AP7-201ENST00000425147 611 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 RPS7P4-201ENST00000444127 582 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 MRPS25-205ENST00000449354 1119 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 LINC01839-201ENST00000451348 727 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 STX1B-202ENST00000565419 834 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 MIR3159-201ENST00000584572 74 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 BX510359.8-201ENST00000617713 296 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 AC087885.1-201ENST00000641910 848 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 AL354740.1-201ENST00000586726 2681 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 UBXN10-201ENST00000375099 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 SYNPO2-204ENST00000448416 4298 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 SPIN3-211ENST00000638712 4286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 APOL1-202ENST00000397278 2918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 FLNB-202ENST00000358537 9391 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 GABRP-206ENST00000519385 1567 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 NHLRC3-203ENST00000470258 3298 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 PSG5-202ENST00000366175 1766 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 RELN-201ENST00000343529 11565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 RELN-202ENST00000424685 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 RELN-203ENST00000428762 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 GPATCH11-202ENST00000409774 3906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 BLOC1S6-218ENST00000568816 4013 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 AC006299.1-203ENST00000499625 2029 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 IDH3A-201ENST00000299518 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 EFNB2-201ENST00000245323 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 TTC25-201ENST00000377540 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 PLXNA2-201ENST00000367033 11444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 FCRLA-201ENST00000236938 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 TPCN1-202ENST00000392569 2558 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 DAB1-206ENST00000414851 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 HCG18-242ENST00000602319 3342 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 LMLN-201ENST00000330198 7043 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 CORO2B-203ENST00000543950 3611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 THOC1-201ENST00000261600 2087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.5 ms