Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NMBRP28336 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NMBRP28336 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NMBRP28336 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NMBRP28336 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NMBRP28336 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NMBRP28336 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NMBRP28336 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NMBRP28336 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NMBRP28336 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NMBRP28336 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NMBRP28336 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NMBRP28336 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NMBRP28336 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NMBRP28336 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NMBRP28336 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NMBRP28336 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NMBRP28336 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NMBRP28336 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NMBRP28336 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NMBRP28336 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NMBRP28336 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NMBRP28336 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NMBRP28336 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NMBRP28336 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NMBRP28336 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NMBRP28336 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NMBRP28336 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NMBRP28336 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NMBRP28336 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NMBRP28336 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NMBRP28336 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NMBRP28336 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NMBRP28336 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NMBRP28336 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NMBRP28336 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NMBRP28336 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NMBRP28336 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NMBRP28336 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NMBRP28336 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NMBRP28336 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NMBRP28336 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NMBRP28336 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NMBRP28336 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NMBRP28336 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NMBRP28336 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NMBRP28336 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NMBRP28336 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NMBRP28336 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NMBRP28336 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.9 ms