Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC011447.6-201ENST00000623510 2598 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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FOXQ1Q9C009 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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FOXQ1Q9C009 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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FOXQ1Q9C009 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 SIRPG-AS1-202ENST00000456177 2795 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
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FOXQ1Q9C009 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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FOXQ1Q9C009 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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FOXQ1Q9C009 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 LINC01677-204ENST00000635342 1329 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 CXCR6-204ENST00000458629 2805 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
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