Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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