Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 CT45A7-201ENST00000610598 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 GSTM2-207ENST00000460717 1449 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 CTPS1-201ENST00000372616 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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GRIK4Q16099 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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GRIK4Q16099 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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GRIK4Q16099 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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