Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms