Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 LINC01047-201ENST00000415193 778 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
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