Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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BNIP1Q12981 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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BNIP1Q12981 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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BNIP1Q12981 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BNIP1Q12981 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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BNIP1Q12981 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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BNIP1Q12981 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BNIP1Q12981 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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BNIP1Q12981 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BNIP1Q12981 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BNIP1Q12981 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BNIP1Q12981 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BNIP1Q12981 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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