Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AP001269.1-201ENST00000592820 528 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
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