Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 CLASP1-215ENST00000541377 7909 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 SPATA13-201ENST00000343003 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 TRIM2-201ENST00000338700 6735 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 ZC3H6-202ENST00000409871 11542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 LRRC37A-201ENST00000320254 5177 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 CHD2-201ENST00000394196 9363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 HIVEP2-203ENST00000367604 10032 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP34Q70CQ2 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
USP34Q70CQ2 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
USP34Q70CQ2 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
USP34Q70CQ2 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
USP34Q70CQ2 NHS-204ENST00000615422 8860 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
USP34Q70CQ2 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
USP34Q70CQ2 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
USP34Q70CQ2 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
USP34Q70CQ2 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
USP34Q70CQ2 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
USP34Q70CQ2 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.64
USP34Q70CQ2 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
USP34Q70CQ2 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
USP34Q70CQ2 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
USP34Q70CQ2 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
USP34Q70CQ2 FRMPD4-202ENST00000616992 7916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
USP34Q70CQ2 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
USP34Q70CQ2 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
USP34Q70CQ2 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.64
USP34Q70CQ2 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
USP34Q70CQ2 AC008124.1-201ENST00000609803 9730 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP34Q70CQ2 KCNMB3-205ENST00000485523 7246 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP34Q70CQ2 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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