Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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